التعليم

المعاهد الوطنية للصحة: ​​زمالة ما بعد الدكتوراه أغسطس 2014
جامعة جون هوبكنز: زمالة ما بعد الدكتوراه أكتوبر 2009
جامعة بوفالو ، جامعة ولاية نيويورك: دكتوراه ، علوم الكمبيوتر ، سبتمبر 2008
ماجستير ، علوم الكمبيوتر فبراير 2005
بكالوريوس أحياء وعلوم كمبيوتر يونيو 2003

خبرة في العمل

أستاذ مساعد: جامعة تكساس إيه آند إم - كينجسفيل أكتوبر 2019 حتى الآن
أستاذ مساعد: جامعة تولسا أغسطس 2014 - مايو 2019

منشورات المجلة

1. A. Zielezinski، HZ Girgis، G. Bernard، C.-A. Leimeister ، K. Tang ، T. Dencker ، J.-J. تشوي ، MS Waterman ، S.-H. Kim، S. Vinga، J. Almeida، C.-X. تشان ، بي تي جيمس ، إف صن ، بي مورجينسترن ، و إم كارلوفسكي. المقارنة المعيارية لطرق مقارنة التسلسل الخالية من المحاذاة. بيولوجيا الجينوم ، 20 (1): 144 ، 2019.
2. A. Velasco II، BT James، VD Wells، HZ Girgis. Look4TRs: أداة de-novo للكشف عن التكرارات الترادفية البسيطة باستخدام نماذج Markov المخفية تحت الإشراف الذاتي. المعلوماتية الحيوية ، btz551 ، 2019.
3. JD فالنسيا و HZ جرجس. LtrDetector: مجموعة أدوات للكشف عن الينقولات العكسية المتكررة للطرف الطويل. BMC Genomics ، 20: 450 ، 2019.
4. HZ Girgis، A. Velasco II، ZE Reyes. HebbPlot: أداة ذكية لتعلم وتصور توقيعات علامة الكروماتين. المعلوماتية الحيوية BMC ، 19: 310 ، 2018.
5. BT James و BB Luczak و HZ Girgis. MeShClust: أداة ذكية لتجميع تسلسل الحمض النووي.
6. بحوث الأحماض النووية ، gky315 ، 2018.
7. BB Luczak و BT James و HZ Girgis. مسح وتقييمات للإحصاءات القائمة على المدرج التكراري في مقارنة التسلسل الخالي من المحاذاة. إحاطات في المعلوماتية الحيوية ، bbx161 ، 2017.
8. هرتز جرجس. الأحمر: أداة ذكية وسريعة ودقيقة لاكتشاف تكرار de-novo على المقياس الجينومي.
9. المعلوماتية الحيوية BMC ، 16 (1): 227 ، 2015.
10. A. Visel ، L. Taher ، HZ Girgis ، MJ Blow ، JA Akiyama et al. أطلس مُحسِّن عالي الدقة للدماغ البيني النامي. الخلية ، 152 (4): 895-908 ، 2013.
11. هرتز جرجس وس. شيتلين. MsDetector: نحو أداة حسابية قياسية للكشف عن السواتل الدقيقة للحمض النووي. بحوث الأحماض النووية ، 41 (1): 22 ، 2013.
12. هرتز جرجس وإي. أوفتشارينكو. توقع الوحدات التنظيمية الخاصة بنسيج رابطة الدول المستقلة في الجينوم البشري باستخدام أزواج من الأشكال المتزامنة. BMC المعلوماتية الحيوية ، 13 (1): 25 ، 2012.

منشورات المؤتمر استعرضها النظراء

1. HZ Girgis و BR Mitchell و T. Dassopoulos و G. Mullin و G. Hager. نظام ذكي للكشف عن التهاب داء كرون في مقاطع فيديو التنظير الداخلي بالكبسولة اللاسلكية. في وقائع ندوة IEEE الدولية حول التصوير الطبي الحيوي ، الصفحات 1373–1376 ، 2010.
2. HZ Girgis و JJ Corso و D. Fischer. التسلسل الهرمي عبر الإنترنت للنماذج الخطية العامة لاختيار وتصنيف أفضل هياكل البروتين المتوقعة. في وقائع المؤتمر الدولي السنوي لهندسة IEEE في جمعية الطب والبيولوجيا ، الصفحات 4949-4953 ، 2009.
3. S. Seshamani ، P. Rajan ، R. Kumar ، HZ Girgis ، G. Mullin ، T. Dassopoulos ، and G. Hager. إطار تسجيل التعريف لمطابقة الآفات. في وقائع المؤتمر الدولي حول حوسبة الصور الطبية والتدخل بمساعدة الحاسوب ، الصفحات 582-589 ، 2009.
4. K. Ho¨ller، J. Penne، A. Schneider، J. Jahn، HZ Girgis، J. Gutierrez، T. Wittenberg، and J. Hornegger. قمع الأخطاء القائمة على الصدمة مع تصحيح الصورة بالمنظار المرتبط بالجاذبية. في وقائع المؤتمر الروسي البافاري الخامس للهندسة الطبية الحيوية ، الصفحات 43-47 ، 2009.
5. HZ Girgis و B. Jayaraman. JavaTA: مصحح أخطاء يعتمد على المنطق لجافا. في ورشة العمل حول الأساليب القائمة على المنطق في بيئات البرمجة ، حجم abs / cs / 0701107 ، 2007.
6. HZ Girgis و B. Jayaraman و P. Gestwicki. تصور الأخطاء في البرامج الشيئية. في Pro-ceedings رفيق لمؤتمر ACM SIGPLAN حول البرمجة الموجهة للكائنات والأنظمة واللغات والتطبيقات ، الصفحات 156-157 ، 2005.

الاهتمامات البحثية الرئيسية

المعلوماتية الحيوية ، التعلم الآلي ، الجينوميات الحاسوبية ، تحليل التسلسل ، والحمض النووي غير المشفر.

الاهتمامات التعليمية الرئيسية

المعلوماتية الحيوية ، والتعلم الآلي ، وهياكل البيانات ، ولغات البرمجة ، وهندسة البرمجيات ، وأنظمة التشغيل.